Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim11aQ99J19 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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