Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim7Q923T7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim7Q923T7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim7Q923T7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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Trim7Q923T7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim7Q923T7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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