Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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