Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms