Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms