Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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Top1mtQ8R4U6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1mtQ8R4U6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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