Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms