Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms