Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ep400Q8CHI8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ep400Q8CHI8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms