Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFU8

Tp53inp2, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53inp2Q8CFU8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53inp2Q8CFU8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms