Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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