Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms