Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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