Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc27Q8CD92 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms