Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp20Q8C6M1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp20Q8C6M1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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