Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms