Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms