Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarsl2Q8BLY2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarsl2Q8BLY2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms