Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot10Q8BH15 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms