Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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