Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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