Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.5Q85ZW7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms