Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms