Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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GypcQ78HU7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GypcQ78HU7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms