Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mindy1Q76LS9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms