Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153 ms