Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms