Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc4Q6P2L7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms