Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrimpolQ6P1E7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms