Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms