Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms