Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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