Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms