Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf9Q61179 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms