Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NinQ61043 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NinQ61043 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NinQ61043 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NinQ61043 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NinQ61043 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NinQ61043 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NinQ61043 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NinQ61043 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NinQ61043 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NinQ61043 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NinQ61043 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NinQ61043 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NinQ61043 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NinQ61043 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NinQ61043 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NinQ61043 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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