Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Grik1Q60934 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Grik1Q60934 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Grik1Q60934 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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