Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a4Q60857 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms