Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms