Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms