Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd40Q5SUE8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms