Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms