Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2f8Q58FA4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms