Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xirp2Q4U4S6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xirp2Q4U4S6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms