Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Obox3Q3UT54 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Obox3Q3UT54 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Obox3Q3UT54 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Obox3Q3UT54 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Obox3Q3UT54 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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