Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms