Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms