Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms