Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms