Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pde12Q3TIU4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms