Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stt3bQ3TDQ1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms